Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA2O00451 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA2O00451 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA2O00451 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA2O00451 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA2O00451 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA2O00451 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA2O00451 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA2O00451 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA2O00451 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA2O00451 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA2O00451 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA2O00451 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA2O00451 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA2O00451 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA2O00451 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA2O00451 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA2O00451 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA2O00451 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA2O00451 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA2O00451 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA2O00451 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA2O00451 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA2O00451 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA2O00451 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA2O00451 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA2O00451 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA2O00451 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA2O00451 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA2O00451 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA2O00451 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA2O00451 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA2O00451 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GFRA2O00451 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GFRA2O00451 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GFRA2O00451 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GFRA2O00451 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GFRA2O00451 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GFRA2O00451 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GFRA2O00451 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GFRA2O00451 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GFRA2O00451 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GFRA2O00451 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GFRA2O00451 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GFRA2O00451 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GFRA2O00451 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GFRA2O00451 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GFRA2O00451 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA2O00451 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA2O00451 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA2O00451 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA2O00451 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA2O00451 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA2O00451 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA2O00451 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA2O00451 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA2O00451 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GFRA2O00451 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA2O00451 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA2O00451 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA2O00451 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA2O00451 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA2O00451 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GFRA2O00451 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA2O00451 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA2O00451 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GFRA2O00451 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA2O00451 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GFRA2O00451 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA2O00451 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA2O00451 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA2O00451 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GFRA2O00451 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA2O00451 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GFRA2O00451 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA2O00451 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA2O00451 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA2O00451 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA2O00451 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA2O00451 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA2O00451 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA2O00451 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA2O00451 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA2O00451 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA2O00451 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA2O00451 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA2O00451 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA2O00451 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA2O00451 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GFRA2O00451 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA2O00451 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA2O00451 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA2O00451 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA2O00451 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA2O00451 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA2O00451 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA2O00451 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA2O00451 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA2O00451 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA2O00451 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms