Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms