Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 AC026786.1-201ENST00000540096 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 AC004889.1-201ENST00000498693 856 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 ANAPC11-214ENST00000578544 403 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 PLA2G15-203ENST00000444212 943 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 EMP3-204ENST00000596315 761 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 RN7SKP212-201ENST00000410851 328 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 OR52V1P-201ENST00000515557 898 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 AC024405.2-201ENST00000528459 810 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 BIRC5-211ENST00000592734 386 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 CBR3-AS1-210ENST00000623484 392 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 CBR3-AS1-215ENST00000624086 594 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 LINC01398-202ENST00000634819 1292 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RGPD3A6NKT7 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 AC068631.1-228ENST00000354642 742 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 LINC01693-202ENST00000430123 357 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms