Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 AC006986.1-201ENST00000612764 241 ntBASIC15.06■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 SLC25A15P1-201ENST00000456738 342 ntBASIC15.05■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC15.05■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
XIRP2A4UGR9 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XIRP2A4UGR9 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
XIRP2A4UGR9 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XIRP2A4UGR9 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XIRP2A4UGR9 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
XIRP2A4UGR9 GTF2I-203ENST00000443166 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XIRP2A4UGR9 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
XIRP2A4UGR9 EEF1DP7-201ENST00000580496 513 ntBASIC15.05■□□□□ -0
XIRP2A4UGR9 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XIRP2A4UGR9 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XIRP2A4UGR9 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XIRP2A4UGR9 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XIRP2A4UGR9 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
XIRP2A4UGR9 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
XIRP2A4UGR9 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
XIRP2A4UGR9 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
XIRP2A4UGR9 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
XIRP2A4UGR9 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XIRP2A4UGR9 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XIRP2A4UGR9 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XIRP2A4UGR9 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
XIRP2A4UGR9 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XIRP2A4UGR9 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
XIRP2A4UGR9 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
XIRP2A4UGR9 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XIRP2A4UGR9 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC15.05■□□□□ -0
XIRP2A4UGR9 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
XIRP2A4UGR9 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC15.05■□□□□ -0
XIRP2A4UGR9 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XIRP2A4UGR9 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XIRP2A4UGR9 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
XIRP2A4UGR9 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
XIRP2A4UGR9 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XIRP2A4UGR9 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
XIRP2A4UGR9 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
XIRP2A4UGR9 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XIRP2A4UGR9 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
XIRP2A4UGR9 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
XIRP2A4UGR9 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
XIRP2A4UGR9 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XIRP2A4UGR9 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
XIRP2A4UGR9 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC15.04■□□□□ -0
XIRP2A4UGR9 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XIRP2A4UGR9 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
XIRP2A4UGR9 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
XIRP2A4UGR9 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
XIRP2A4UGR9 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
XIRP2A4UGR9 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC15.04■□□□□ -0
XIRP2A4UGR9 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XIRP2A4UGR9 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XIRP2A4UGR9 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XIRP2A4UGR9 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XIRP2A4UGR9 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XIRP2A4UGR9 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
XIRP2A4UGR9 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC15.04■□□□□ -0
XIRP2A4UGR9 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
XIRP2A4UGR9 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC15.04■□□□□ -0
XIRP2A4UGR9 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
XIRP2A4UGR9 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
XIRP2A4UGR9 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms