Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
GIT1Q9Y2X7 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIT1Q9Y2X7 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIT1Q9Y2X7 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIT1Q9Y2X7 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIT1Q9Y2X7 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIT1Q9Y2X7 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIT1Q9Y2X7 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIT1Q9Y2X7 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIT1Q9Y2X7 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIT1Q9Y2X7 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GIT1Q9Y2X7 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIT1Q9Y2X7 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIT1Q9Y2X7 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIT1Q9Y2X7 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIT1Q9Y2X7 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIT1Q9Y2X7 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIT1Q9Y2X7 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIT1Q9Y2X7 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIT1Q9Y2X7 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIT1Q9Y2X7 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GIT1Q9Y2X7 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIT1Q9Y2X7 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIT1Q9Y2X7 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIT1Q9Y2X7 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIT1Q9Y2X7 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIT1Q9Y2X7 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIT1Q9Y2X7 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIT1Q9Y2X7 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIT1Q9Y2X7 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIT1Q9Y2X7 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIT1Q9Y2X7 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIT1Q9Y2X7 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIT1Q9Y2X7 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIT1Q9Y2X7 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIT1Q9Y2X7 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIT1Q9Y2X7 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GIT1Q9Y2X7 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GIT1Q9Y2X7 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GIT1Q9Y2X7 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GIT1Q9Y2X7 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIT1Q9Y2X7 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIT1Q9Y2X7 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIT1Q9Y2X7 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GIT1Q9Y2X7 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIT1Q9Y2X7 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIT1Q9Y2X7 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIT1Q9Y2X7 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIT1Q9Y2X7 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIT1Q9Y2X7 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIT1Q9Y2X7 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIT1Q9Y2X7 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIT1Q9Y2X7 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIT1Q9Y2X7 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GIT1Q9Y2X7 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GIT1Q9Y2X7 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIT1Q9Y2X7 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIT1Q9Y2X7 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIT1Q9Y2X7 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIT1Q9Y2X7 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms