Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
COPS7AQ9UBW8 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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COPS7AQ9UBW8 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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COPS7AQ9UBW8 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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COPS7AQ9UBW8 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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COPS7AQ9UBW8 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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COPS7AQ9UBW8 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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