Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms