Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms