Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
USP29Q9HBJ7 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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