Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCSER1Q9C0I3 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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