Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.05■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM4Q9C037 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms