Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TDRD1Q9BXT4 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms