Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms