Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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PKP4Q99569 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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PKP4Q99569 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PKP4Q99569 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PKP4Q99569 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PKP4Q99569 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PKP4Q99569 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PKP4Q99569 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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