Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX27Q96L92 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms