Protein–RNA interactions for Protein: Q96F07

CYFIP2, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP2Q96F07 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYFIP2Q96F07 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYFIP2Q96F07 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CYFIP2Q96F07 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYFIP2Q96F07 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYFIP2Q96F07 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYFIP2Q96F07 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CYFIP2Q96F07 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYFIP2Q96F07 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYFIP2Q96F07 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYFIP2Q96F07 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYFIP2Q96F07 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYFIP2Q96F07 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms