Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SIRT1Q96EB6 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms