Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms