Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHMTQ93088 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms