Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms