Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RNF182Q8N6D2 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RNF182Q8N6D2 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RNF182Q8N6D2 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RNF182Q8N6D2 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RNF182Q8N6D2 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RNF182Q8N6D2 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RNF182Q8N6D2 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
RNF182Q8N6D2 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RNF182Q8N6D2 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RNF182Q8N6D2 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RNF182Q8N6D2 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RNF182Q8N6D2 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RNF182Q8N6D2 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RNF182Q8N6D2 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
RNF182Q8N6D2 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RNF182Q8N6D2 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RNF182Q8N6D2 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RNF182Q8N6D2 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RNF182Q8N6D2 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RNF182Q8N6D2 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RNF182Q8N6D2 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RNF182Q8N6D2 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RNF182Q8N6D2 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RNF182Q8N6D2 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RNF182Q8N6D2 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RNF182Q8N6D2 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RNF182Q8N6D2 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RNF182Q8N6D2 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RNF182Q8N6D2 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RNF182Q8N6D2 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RNF182Q8N6D2 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RNF182Q8N6D2 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms