Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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ATG4DQ86TL0 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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ATG4DQ86TL0 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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ATG4DQ86TL0 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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ATG4DQ86TL0 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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ATG4DQ86TL0 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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ATG4DQ86TL0 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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ATG4DQ86TL0 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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ATG4DQ86TL0 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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ATG4DQ86TL0 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ATG4DQ86TL0 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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