Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHA9Q7RTU4 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms