Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FNDC1Q4ZHG4 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms