Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP28Q4G0W2 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms