Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UVSSAQ2YD98 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms