Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGSM1Q2NKQ1 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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