Protein–RNA interactions for Protein: Q16875

PFKFB3, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB3Q16875 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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PFKFB3Q16875 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFKFB3Q16875 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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PFKFB3Q16875 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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PFKFB3Q16875 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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PFKFB3Q16875 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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PFKFB3Q16875 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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PFKFB3Q16875 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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PFKFB3Q16875 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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PFKFB3Q16875 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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PFKFB3Q16875 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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PFKFB3Q16875 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PFKFB3Q16875 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PFKFB3Q16875 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PFKFB3Q16875 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PFKFB3Q16875 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PFKFB3Q16875 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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PFKFB3Q16875 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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PFKFB3Q16875 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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PFKFB3Q16875 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PFKFB3Q16875 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PFKFB3Q16875 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PFKFB3Q16875 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PFKFB3Q16875 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PFKFB3Q16875 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PFKFB3Q16875 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PFKFB3Q16875 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PFKFB3Q16875 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PFKFB3Q16875 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PFKFB3Q16875 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PFKFB3Q16875 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PFKFB3Q16875 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PFKFB3Q16875 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PFKFB3Q16875 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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