Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITSN1Q15811 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
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