Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms