Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PUM3Q15397 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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