Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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