Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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