Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
EBI3Q14213 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms