Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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