Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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ITGA7Q13683 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA7Q13683 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA7Q13683 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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ITGA7Q13683 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA7Q13683 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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ITGA7Q13683 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA7Q13683 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA7Q13683 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA7Q13683 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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ITGA7Q13683 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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ITGA7Q13683 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA7Q13683 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA7Q13683 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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ITGA7Q13683 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA7Q13683 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA7Q13683 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA7Q13683 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA7Q13683 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA7Q13683 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA7Q13683 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA7Q13683 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA7Q13683 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA7Q13683 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA7Q13683 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
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ITGA7Q13683 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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ITGA7Q13683 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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ITGA7Q13683 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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ITGA7Q13683 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA7Q13683 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA7Q13683 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA7Q13683 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA7Q13683 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA7Q13683 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA7Q13683 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA7Q13683 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA7Q13683 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA7Q13683 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA7Q13683 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA7Q13683 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA7Q13683 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA7Q13683 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA7Q13683 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA7Q13683 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA7Q13683 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ITGA7Q13683 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
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