Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 DUSP14-205ENST00000614411 2207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBX3Q13185 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 PAX8-202ENST00000263335 3735 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 SMG8-202ENST00000543872 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 TPX2-202ENST00000340513 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBX3Q13185 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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