Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTP4A2Q12974 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTP4A2Q12974 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms