Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms