Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDH17Q12864 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH17Q12864 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH17Q12864 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH17Q12864 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CDH17Q12864 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDH17Q12864 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDH17Q12864 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDH17Q12864 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH17Q12864 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CDH17Q12864 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH17Q12864 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDH17Q12864 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH17Q12864 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH17Q12864 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH17Q12864 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH17Q12864 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH17Q12864 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH17Q12864 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH17Q12864 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH17Q12864 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDH17Q12864 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH17Q12864 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDH17Q12864 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDH17Q12864 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH17Q12864 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDH17Q12864 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDH17Q12864 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDH17Q12864 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDH17Q12864 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDH17Q12864 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDH17Q12864 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDH17Q12864 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDH17Q12864 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDH17Q12864 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDH17Q12864 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDH17Q12864 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CDH17Q12864 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDH17Q12864 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CDH17Q12864 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDH17Q12864 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDH17Q12864 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CDH17Q12864 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CDH17Q12864 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CDH17Q12864 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDH17Q12864 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CDH17Q12864 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDH17Q12864 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CDH17Q12864 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CDH17Q12864 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDH17Q12864 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDH17Q12864 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CDH17Q12864 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDH17Q12864 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDH17Q12864 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDH17Q12864 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDH17Q12864 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CDH17Q12864 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDH17Q12864 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDH17Q12864 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDH17Q12864 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDH17Q12864 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDH17Q12864 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDH17Q12864 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CDH17Q12864 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDH17Q12864 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDH17Q12864 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDH17Q12864 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH17Q12864 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH17Q12864 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH17Q12864 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH17Q12864 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH17Q12864 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH17Q12864 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDH17Q12864 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDH17Q12864 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDH17Q12864 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDH17Q12864 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDH17Q12864 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH17Q12864 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH17Q12864 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH17Q12864 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDH17Q12864 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH17Q12864 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDH17Q12864 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH17Q12864 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH17Q12864 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDH17Q12864 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH17Q12864 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH17Q12864 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH17Q12864 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH17Q12864 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDH17Q12864 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH17Q12864 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDH17Q12864 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH17Q12864 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH17Q12864 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH17Q12864 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDH17Q12864 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDH17Q12864 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms