Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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SMARCB1Q12824 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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SMARCB1Q12824 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMARCB1Q12824 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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SMARCB1Q12824 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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SMARCB1Q12824 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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SMARCB1Q12824 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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SMARCB1Q12824 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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SMARCB1Q12824 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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SMARCB1Q12824 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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SMARCB1Q12824 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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SMARCB1Q12824 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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SMARCB1Q12824 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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