Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TROQ12816 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TROQ12816 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TROQ12816 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TROQ12816 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TROQ12816 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TROQ12816 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TROQ12816 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TROQ12816 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TROQ12816 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TROQ12816 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TROQ12816 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TROQ12816 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TROQ12816 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TROQ12816 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TROQ12816 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TROQ12816 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TROQ12816 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TROQ12816 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TROQ12816 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TROQ12816 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TROQ12816 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TROQ12816 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TROQ12816 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TROQ12816 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TROQ12816 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TROQ12816 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TROQ12816 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TROQ12816 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TROQ12816 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TROQ12816 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TROQ12816 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TROQ12816 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TROQ12816 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TROQ12816 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TROQ12816 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TROQ12816 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TROQ12816 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TROQ12816 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TROQ12816 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TROQ12816 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TROQ12816 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TROQ12816 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TROQ12816 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TROQ12816 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TROQ12816 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TROQ12816 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TROQ12816 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TROQ12816 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TROQ12816 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TROQ12816 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TROQ12816 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TROQ12816 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TROQ12816 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TROQ12816 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TROQ12816 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TROQ12816 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TROQ12816 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TROQ12816 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TROQ12816 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TROQ12816 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TROQ12816 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TROQ12816 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TROQ12816 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TROQ12816 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TROQ12816 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TROQ12816 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TROQ12816 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TROQ12816 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TROQ12816 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TROQ12816 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TROQ12816 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TROQ12816 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TROQ12816 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TROQ12816 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TROQ12816 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TROQ12816 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TROQ12816 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TROQ12816 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TROQ12816 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TROQ12816 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TROQ12816 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TROQ12816 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TROQ12816 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TROQ12816 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TROQ12816 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TROQ12816 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TROQ12816 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TROQ12816 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TROQ12816 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TROQ12816 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TROQ12816 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TROQ12816 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TROQ12816 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TROQ12816 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TROQ12816 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TROQ12816 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TROQ12816 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TROQ12816 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TROQ12816 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms