Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DDR1Q08345 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms