Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBXN1Q04323 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms