Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARID5AQ03989 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARID5AQ03989 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARID5AQ03989 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARID5AQ03989 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARID5AQ03989 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ARID5AQ03989 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARID5AQ03989 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARID5AQ03989 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARID5AQ03989 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARID5AQ03989 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARID5AQ03989 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARID5AQ03989 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARID5AQ03989 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARID5AQ03989 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARID5AQ03989 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARID5AQ03989 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARID5AQ03989 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARID5AQ03989 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARID5AQ03989 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARID5AQ03989 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARID5AQ03989 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARID5AQ03989 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARID5AQ03989 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARID5AQ03989 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARID5AQ03989 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARID5AQ03989 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARID5AQ03989 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms