Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms