Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.06
OTUD4Q01804 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTUD4Q01804 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms