Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MC1RQ01726 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms