Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK17Q00537 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms