Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RPL23P62829 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPL23P62829 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPL23P62829 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPL23P62829 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPL23P62829 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPL23P62829 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPL23P62829 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPL23P62829 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPL23P62829 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPL23P62829 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPL23P62829 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPL23P62829 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPL23P62829 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPL23P62829 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPL23P62829 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPL23P62829 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPL23P62829 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPL23P62829 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPL23P62829 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPL23P62829 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPL23P62829 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPL23P62829 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPL23P62829 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPL23P62829 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPL23P62829 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPL23P62829 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPL23P62829 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
RPL23P62829 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPL23P62829 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPL23P62829 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPL23P62829 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPL23P62829 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPL23P62829 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
RPL23P62829 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms